Στην πραγματικότητα, σύμφωνα με τη Μαρία Μουστάκα, καθηγητής βιολογίας στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, υπάρχει ελάχιστη ή και καθόλου διαθέσιμα στοιχεία για τουλάχιστον 20 από 50 στην Ελλάδα λίμνες, αν και ένα πρόγραμμα του Υπουργείου Περιβάλλοντος έχει οριστεί να ξεκινήσει το 2012 - πέντε χρόνια πίσω χρονοδιάγραμμα - να κάνει ένα πλήρες μητρώο των λιμνών στην Ελλάδα, με όλα τα χαρακτηριστικά τους.
Για χρόνια, η Ελλάδα έχει κατά παράβαση της οδηγίας πλαίσιο για τα ύδατα της Ευρωπαϊκής Επιτροπής, η οποία απαιτεί από όλα τα κράτη μέλη της ΕΕ να καθαρίσει τις λίμνες τους μέχρι το 2015. Η χώρα έχει αποτύχει να εκπονήσει μια στρατηγική για την επίτευξη του ευρωπαϊκού στόχου της Ένωσης, συμπεριλαμβανομένης της λήψης μέτρων για την πρόληψη και έλεγχο της ρύπανσης και αποκατάστασης.
